Il y a plein de choses que je ne connais pas dans la liste, mais la liste est longue.
Pour Twin Peaks, il te faudra une voiture.
La lendemain, pour le vélo, tu peux peut-être le louer juste avant d'aller à Sausalito ?
Je ne sais pas, mais Lombard Street, monter et descendre toutes ces rues du quartier en pente à vélo, ça me semble... euh... intense !

Regarde bien les horaires du ferry, question de ne pas louper ton tour à Alcatraz.
Pour les changements d'horaires, tu te poses trop de questions et en effet tu te prends la tête... pour rien !

Un changement d'heure n'a d'importance que si tu as réservé un tour guidé. Le reste, honnêtement, une fois sur place, on s'en fout, on est en vacances. Tu verras, là bas tu vivras avec le soleil.
En venant de Vegas, peu importe que ce soit 13 h 00 ou 14 h 00 en arrivant au Grand Canyon, ça ne changera absolument rien à ta visite.
Tu vas me dire oui, mais le crépuscule, etc... ok, mais en général on ne se point pas au crépuscule à l'heure dite. Ce qu'il y a d'intéressant, c'est de voir la lumière tomber lentement sur la roche rouge, voir des dégradés incroyables se créer, voir les ombres s'allonger, etc... Grosso modo, le crépuscule c'est 16 h 00 / 19 h 00 ou 20 h 00 tous les jours (selon la saison).
Pour Antelope Canyon, en Octobre, ça ne sera plus un problème. Il n'y aura plus les fameux rayons de soleil à la vertical entre midi et 14 h 00 dans le Upper à cette saison et le Lower, de toutes façons, il est beau tout le temps (même si encore plus le matin).
Pour ce qui est du changement à l'heure d'hiver aux USA, c'est marqué dans la fiche pratique : 6 Novembre 2011. Donc en Octobre, tu seras encore à l'heure d'été.